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南门和东门都可以。三清山入口主要包括南部和东部，即南外双溪索道和东金沙索道。两条索道改造后，因为三清山核心景区不大，两个入口的游览路线差不多，风景一样。
差异：
1.南边索道旁边有徒步入口，可以选择不坐索道；
2.东部索道附近没有徒步入口，只能坐索道，靠近婺源。