SSR分子标记原理

SSR分子标记原理：基因组中某个特定微卫星的侧翼序列通常是一个保守性很强的单一序列。可以克隆微卫星侧翼的DNA片段并测序，根据微卫星的侧翼序列人工合成引物进行PCR扩增，从而扩增出单个微卫星位点。单个微卫星基因座重复单位数量的变化和个体扩增产物长度的变化导致长度多态性，称为简单序列重复长度多态性(SSLP)。每个扩增的基因座代表该基因座的一对等位基因。因为SSR重复的数量变化很大，SSR标记可以揭示比RFLP高得多的多态性。