1.诉讼目的不同。民事诉讼是解决平等主体之间的民事权利义务纠纷；行政诉讼要解决的是国家行政机关的具体行政行为是否合法、正确；刑事诉讼要解决的是涉嫌犯罪的人是否实际犯了罪，犯了什么罪，应该受到什么样的处罚的问题。
2.诉讼主体不同。民事诉讼中，双方都可以提起诉讼，原告提起诉讼后，被告可以反诉；行政诉讼只能由行政管理相对人提起，行政机关始终处于被告地位，不能反诉；在刑事诉讼中，除自诉案件外，公诉由人民检察院提起。
3.举证责任不同。民事诉讼中，谁主张权利，谁负责举证；在行政诉讼中，只有被告(行政机关)负有举证责任；在刑事诉讼中，公诉人有责任提供被告有罪的证据并加以证明。被告不承担举证责任，但可以提出自己未成年或无罪的材料为自己辩护。
4.适用的法律不同。民事诉讼主要适用于《民法通则》和《民事诉讼法》；行政诉讼主要适用于行政法规和《行政诉讼法》；刑事诉讼主要适用《刑法》和《刑事诉讼法》。